在申请日本商标注册时，有一些标记是不能被申请的。这些标记可能违反了相关法律法规，或者已经被他人注册为商标，因此无法再次申请。以下是一些常见的不能申请日本商标注册的标记：

1. 违反公序良俗的标记

根据日本商标法，违反公序良俗的标记，无法被注册为商标。这包括具有淫秽、诽谤、歧视等不合适内容的标记。商标是企业形象的代表，应该是正面、健康、积极的形象，因此违反公序良俗的标记是无法通过注册的。

2. 与众多商标相似的标记

在申请商标注册时，有可能会与已经注册的商标非常相似的标记。如果新申请的商标与已注册的商标在音、形、意义上相似度过高，容易引起混淆，这种情况下申请是无法通过的。这是为了保护已注册商标的权益，避免造成市场混乱。

3. 具有特定国别或地区名称的标记

商标注册也不能包含特定国别或地区的名称。这是为了避免产生误导，让消费者以为产品是从某个或地区生产的，从而对商标拥有者和消费者造成困扰。例如，不能注册一个产品商标为“日本制造”或者“Made in Japan”，因为这会让消费者误以为产品是日本制造的。

总结：

日本商标注册存在一些不能申请的标记。这些包括违反公序良俗的标记、与已注册商标相似的标记以及具有特定国别或地区名称的标记。这些限制是为了保护商标权益，维护市场秩序，避免误导和混淆。在申请日本商标注册时，需要遵守这些规定，选择合适的商标标记，以确保申请通过。