商标是企业重要的知识产权之一，它代表着企业的形象和声誉，保护商标权益是企业保持竞争力的关键。在某些情况下，当商标权利被侵犯时，申请人需要通过商标行政诉讼来保护自己的权益。然而，在提交商标行政诉讼立案文件之前，申请人需要准备一系列的材料来支持自己的诉讼请求。

一、备案的商标文件

申请人在提交商标行政诉讼立案文件时，首先需要提供商标注册证书或商标注册申请受理通知书。这些文件是证明商标存在及合法性的重要依据，也是申请人行使商标权益的基础。此外，申请人还需要提供商标的样张和商品/服务使用说明，这些文件可以进一步证明商标的特征和范围。

二、商标侵权证据

在商标行政诉讼中，申请人需要提供充分的证据来证明对方侵犯了自己的商标权益。这些证据可以包括相关商标使用的实物证据、销售记录、广告宣传材料、侵权商品的样张等。此外，申请人还可以提供相关权威机构的鉴定报告，证明商标的独立性和显著性，从而进一步加强自己的诉讼请求。

三、委托代理文件

如果申请人委托了律师或法律机构代理商标行政诉讼，那么在提交立案文件时，申请人还需要提供委托代理文件。这份文件需要明确授权代理人代表申请人进行商标行政诉讼，并提供代理人的相关资质证明。委托代理文件的准备有助于确保申请人的诉讼请求能够被有效表达和落实。

综上所述，在提交商标行政诉讼立案文件时，申请人需要准备备案的商标文件、商标侵权证据以及委托代理文件。这些材料的准备是确保申请人的诉讼请求得到充分支持和认可的关键，也是保护商标权益的有力武器。