商标注册是保护企业知识产权的重要手段，而在先著作权指的是在别人注册商标之前已经有了使用该商标的先行权。在商标注册过程中，如何保护自己的在先著作权是一个关键问题。以下是专家对此提出的一些建议。

第一点：积极收集证据材料

在商标注册过程中，如果发现有他人使用了与自己在先著作权相同或相似的商标，应立即采取行动。首先，应积极收集证据材料，包括但不限于商标使用的时间、地点、方式等，以便后续证明自己的在先著作权。同时还可以通过商标局注册查询、行业协会等渠道，了解到其他企业是否存在类似的商标注册申请，以及与自己所使用商标相关的曾经被驳回注册的案例，这些都可以成为证明自己在先著作权的有力证据。

第二点：合理运用商标续展期限

商标的续展期限是商标注册有效期届满后继续保持商标权益的手段。在商标注册过程中，如果发现有他人使用了与自己在先著作权相同或相似的商标，但其商标下一年度续展期限即将到期，这时可以选择合理运用商标续展期限。例如，及时申请对该商标的异议、冻结其商标的续展手续等，以保护自己的先行权。

第三点：寻求法律援助

如果无法通过上述方式保护自己的在先著作权，还可以考虑寻求法律援助。专业的律师可以根据具体情况，帮助企业制定相应的保护方案，并提供法律意见和支持。法律援助不仅可以为企业提供法律武器，还可以在商标注册过程中主动维权，保护企业的在先著作权。

综上所述，保护商标注册中的在先著作权需要企业积极收集证据材料、合理运用商标续展期限，并寻求法律援助。这些措施都可以帮助企业维护自己的知识产权，保护自己的商标权益。