马德里商标注册与单一注册之间存在许多差异，这些差异涉及到申请流程、费用、时间和法律保护等方面。了解这些差异对于企业在全球范围内保护自己的商标权益至关重要。

一、申请流程：

单一注册通常需要通过该的商标局进行申请，需要填写相关表格并提交必要的文件和证明材料。申请人需要对目标的商标法规进行了解，并且需要有足够的语言能力与当地商标局进行沟通。

而马德里商标注册则通过国际商标注册局（WIPO）进行申请，可以由申请人在整个国际范围内提交一份统一的申请文件。这个文件将会转发给所选择的目标商标局进行审核和批准。申请人只需要与国际商标局进行沟通，并且可以使用一种共同的语言，无需给每个目标逐一提交翻译文件。

二、费用：

单一注册的费用因而异，根据商标类别和商品数量的不同可能会有所变动。这些费用包括申请费、注册费以及年度维持费等。有些还可能要求支付检索费等其他附加费用。

相比之下，马德里商标注册的费用较为统一。申请人只需要缴纳国际商标注册费用和手续费即可，无需给每个目标分别支付费用。这在一定程度上减轻了企业的负担。

三、时间：

单一注册的时间较长，整个审核过程通常需要数月或更长时间。由于需要与不同的商标局进行沟通，申请人需要耗费大量的时间和精力。

而马德里商标注册可以加快整个流程。一旦申请被国际商标注册局接受，申请人将立即获得国际注册资格，并有机会在各个目标获得保护。这对于迅速进入多个市场的企业来说尤为重要。

总结起来，马德里商标注册与单一注册之间存在着诸多差异。马德里商标注册具有简化流程、统一费用和加快审核的优势，适用于希望在多个范围内保护自己商标权益的企业。而单一注册则需要对当地法规进行深入了解，并且耗费更多的时间和资源。

无论选择哪种方式，企业在进行商标注册前都应充分了解目标的商标法规，并根据自身需求和资源状况做出明智的决策。