商标是企业的重要资产之一，具有标识产品或服务源头的功能。商标注册是保护商标权益的重要手段之一，通过注册可以获得排他性权利，防止他人擅自使用相同或类似的商标。在进行商标注册时，有些企业会选择将商标分开注册，这样做有一定的优势。

优势一：降低注册风险

将商标分开注册可以有效降低注册风险。在进行商标注册前，企业需要进行一系列的调研工作，包括市场调研、商标查询等。如果企业准备将多个商标注册在一起，那么对于每个商标都需要进行全面严格的调研工作。而将商标分开注册，则可以将风险分散，对每个商标进行更加细致的调研，大大降低了注册的风险。

优势二：灵活运用商标

分开注册商标还可以为企业提供更大的灵活性。在商标的使用上，不同的商标往往有不同的用途和职能，分开注册可以使企业更加灵活地运用商标。例如，企业可以选择将主品牌商标和产品商标分别进行注册，这样在品牌推广时可以更加突出主品牌的形象，而在产品推广时可以更好地营造产品个性和特点。

优势三：降低维权成本

对于商标权益的保护，在发生侵权等情况时，需要进行相关的维权行动。如果将商标分开注册，那么在维权时企业可以有更多的选择。例如，某个商标遭受了侵权，如果将多个商标注册在一起，那么一旦发生问题，需要同时处理多个商标的维权事务，会增加企业的维权成本和精力。而将商标分开注册，则可以分别处理，更加有针对性地维护商标权益，降低了维权的成本。

综上所述，将商标分开注册具有降低注册风险、灵活运用商标和降低维权成本的优势。企业在进行商标注册时，可以考虑将商标进行分离，以提高商标的保护效果和灵活运用的能力。