长三角地区是我国经济发展最为活跃的区域之一，知识产权保护和运用对于促进地区经济创新发展至关重要。为了更好地保护和利用地理标志，各地知识产权部门应建立合作机制，增强地理标志保护的力度和效果。

一、加强地理标志保护意识

地理标志是指因特定地理环境、自然条件或人为因素赋予的商品的特殊质量、声誉或其他特征，具有地域标识功能的商标。长三角地区拥有丰富的地理标志资源，如杭州的西湖龙井茶、苏州的苏锡常稻米等。在建立地理标志保护机制的同时，必须加强公众对地理标志的认识和保护意识，提高对知识产权保护的重视度。相关部门可以通过开展宣传教育活动、举办知识产权培训班等方式，增加公众对地理标志保护的了解，从而促进地理标志的保护和运用。

二、建立地理标志保护协作机制

地理标志的保护面临着跨地区、跨部门的问题，需要各地知识产权部门建立起协作机制，共同推进地理标志保护工作。首先，可以成立地理标志保护专项工作组，由相关部门的专家组成，负责统筹管理地理标志保护工作。其次，要加强不同地区之间的沟通和交流，定期召开地理标志保护座谈会、研讨会等活动，共同研究解决地理标志保护中的实际问题。最后，建立健全地理标志保护信息交流平台，方便各地知识产权部门之间及时分享信息、经验和资源。

三、加大地理标志运用力度

地理标志的保护不仅限于保护原创，还需要积极推动地理标志的运用和开发。长三角地区的地理标志产品具有独特的地域文化和市场竞争力，通过运用地理标志，可以提升产品的附加值和品牌形象。各地知识产权部门可以与企业合作，推动地理标志产品的包装设计、市场推广等环节，提高产品的竞争力和附加值。同时，在地理标志运用的过程中，要加强知识产权保护，防止侵权行为的发生，维护地理标志的独占权益。

综上所述，长三角地区知识产权部门建立地理标志保护和运用合作机制，是促进地区经济创新发展的重要举措。通过加强地理标志保护意识、建立保护协作机制以及加大地理标志运用力度，可以提高地理标志的保护水平和经济效益，为地区经济发展注入强劲动力。